IFSM از سال 1976 عضو شده است.
فدراسیون بین المللی انجمن های میکروسکوپی توسط ICSU در سال 1951 به عنوان کمیسیون مشترک میکروسکوپ الکترونی ایجاد شد. این فدراسیون در سال 1955 با هدف توسعه همکاری بین المللی بین میکروسکوپیست ها به یک فدراسیون مستقل تبدیل شد. این فدراسیون دارای سه کمیته منطقه ای، 38 انجمن ملی عضو، و 6 انجمن ملی عضو وابسته است.